Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTPS1P17812 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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