Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRT10P13645 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms