Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms