Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms