Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD4P09016 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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