Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1O95273 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms