Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TULP3O75386 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TULP3O75386 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TULP3O75386 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms