Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms