Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms