Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms