Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PATL2C9JE40 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATL2C9JE40 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms