Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GOLGA6L9A6NEM1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms