Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SH3BP1Q9Y3L3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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