Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UTP11Q9Y3A2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms