Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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COPS3Q9UNS2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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