Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms