Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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COPS7AQ9UBW8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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COPS7AQ9UBW8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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COPS7AQ9UBW8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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COPS7AQ9UBW8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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COPS7AQ9UBW8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
COPS7AQ9UBW8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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COPS7AQ9UBW8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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COPS7AQ9UBW8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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COPS7AQ9UBW8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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