Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLKQ9UBT6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms