Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DKK3Q9UBP4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms