Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGC1AQ9UBK2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms