Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC17A6Q9P2U8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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