Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms