Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms