Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms