Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf109Q9NX04 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms