Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms