Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms