Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C11orf49Q9H6J7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms