Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms