Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms