Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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