Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM175Q9BSA9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms