Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM56Q9BRZ2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms