Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms