Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms