Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms