Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms