Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms