Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPS3Q969F9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPS3Q969F9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms