Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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GTF3C6Q969F1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GTF3C6Q969F1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF3C6Q969F1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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GTF3C6Q969F1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GTF3C6Q969F1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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GTF3C6Q969F1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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GTF3C6Q969F1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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