Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-CQ95604 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms