Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ52

CHPF, Chondroitin sulfate synthase 2, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPFQ8IZ52 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CHPFQ8IZ52 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHPFQ8IZ52 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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