Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPAP2Q8IXW5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms