Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PBRM1Q86U86 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PBRM1Q86U86 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms