Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms