Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms