Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBAP2Q5T6F2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBAP2Q5T6F2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms