Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF2Q5BJF6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms