Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFT2D3Q587I9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFT2D3Q587I9 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFT2D3Q587I9 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFT2D3Q587I9 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFT2D3Q587I9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SFT2D3Q587I9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SFT2D3Q587I9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SFT2D3Q587I9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SFT2D3Q587I9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D3Q587I9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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