Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms